تقوم الوكالة بمتابعة كافة الأعمال المتعلقة بالدراسات العليا والبحث العلمي، و أبرز مهامها هي:
- الإشراف على جميع برامج الدراسات العليا بالكلية.
- السعي لاستحداث برامج دراسات عليا تتفق مع رؤية الكلية والجامعة و رؤية المملكة 2030.
- العمل على تطوير وتقييم برامج الدراسات العليا بالكلية.
- الإشراف على مختلف الوحدات واللجان التابعة للوكالة.
- السعي إلى زيادة كمية وجودة الإنتاج البحثي العلمي للكية.
- تفعيل دور الكلية في خدمة المجتمع.